本书反映了三十多年来对细胞自动机（CA）的研究，以及近十年来应用CA对生物串进行建模的工作，这构成了由初创公司CARLBio开创的 "新型计算生物学 "的基础。在简要介绍了细胞自动机（CA）理论和功能生物学之后，报告了用CA对基本生物串进行建模，从基本核苷酸开始，到密码子和反密码子CA模型。它推导出更多涉及DNA、RNA、氨基酸形成的整个翻译过程以及蛋白质进化到其独特结构和功能的CA模型。在随后的章节中，还对蛋白质与其他生物分子的相互作用进行了建模。假设唯一必要的前期知识是计算机编程和生物学的本科知识。
本书采用了一种实践的、"自己动手 "的方法，使读者能够应用所提供的方法来推导出CA规则，并理解这些规则与生物学中观察到的物理 "规则 "之间的关系。在一个单一的框架中，作者提出了科学的两个分支--计算和生物学。本书没有采用严格的分子动力学建模（作者将其描述为自下而上的模型），也没有依赖自上而下的新时代人工智能（AI）和机器语言（ML），而是从自上而下和自下而上的方法中汲取精华，确定了复杂分子的行为是如何在CA中体现的。CA规则来自于在生物界观察到的分子相互作用和构造的基本知识，但映射到少数已知结果的子集，以推导和预测结果。
本书对那些想从不同角度探索物理世界复杂系统的建模和模拟的学生、研究人员和行业从业人员很有用。它提出了一个不可避免的问题--"生命和宇宙是否只是处理信息的连续系统的集合"。
